鼬是一个天才，他富有智慧，理智，善于思考，7岁时就能以影的角度思考问题，因此鼬从小的思想也没有被一族和村子的限界所束缚。有些沉默寡言，不善交流，因此鼬的童年时期在同龄人和甚至比自己稍微年长的人中，鼬的思想和成熟也使他显得有些孤立。
有自我牺牲精神，受止水的影响，认为忍者是为了实现目标而忍辱负重之人，也因此他自愿成为了罪人而灭族，背负了整个木叶和佐助的仇恨与黑暗；鼬是个非常热爱村子的人，即使这个村子有着无数黑暗和矛盾，他也依旧以自己身为木叶的忍者而感到骄傲为了村子和弟弟的安危，鼬选择灭族后隐藏真相成为S级叛忍并加入“晓”组织。
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鼬深爱着自己唯一的弟弟佐助，在童年的佐助的记忆中，鼬一直是个温柔、优秀、溺爱着自己的好哥哥，鼬为了守护村子而选择了灭族，但是唯有佐助，鼬无论如何也无法下手，对佐助表示“无论你今后怎么走，我都一直深爱着你”。木叶九尾之乱中，5岁的鼬一个人在家保护还是婴儿的弟弟佐助。7岁从忍者学校毕业，鼬是宇智波一族与宇智波止水齐名的少年天才，两人也是挚友。第三次忍界大战，鼬年仅4岁就目睹了太多的死亡，对于这么小年纪就经历战争的他来说，战争简直就是地狱，这个创伤使鼬厌恶战乱，从此成为一个热爱和平的男人。7岁以全校第一的成绩从忍者学校毕业实际上鼬6岁就有毕业的水准，但是因为战后制度的原因还是使其在7岁毕业，被称为老师成为他见过最优秀的学生（并非建校以来最优秀，因为卡卡西5岁就毕业了）。
三代目火影猿飞日斩评价过鼬7岁的时候就能像火影一样思考问题，8岁便开了写轮眼。10岁升为中忍，11岁加入暗部，受止水影响，从小的他就能超越狭隘的本族主义，尽心尽力为村子做事。加入暗部后的他的能力更是得到了队长旗木卡卡西的肯定，在加入暗部后由于出色的才能不久便被“借调”到了志村团藏所在的暗部。加入暗部的他不但承担着宇智波一族与村子沟通的桥梁，更是作为木叶和宇智波的双重间谍而往来于两者之间。
宇智波政变前夕木叶九尾之乱后高层怀疑操控这一变乱的人是宇智波鼬的写轮眼
鼬的写轮眼族人（其实就是宇智波带土，但不是族人授意的），于是在志村团藏的建议下对宇智波地区进行24小时监控，本就因为二代目火影以建立木叶警务部队为由将宇智波一族隔离的木叶基本政策而不满的宇智波族人终于爆发了出来，企图在由宇智波鼬的父亲宇智波富岳领导的村子的政治斗争中夺取自己的地位。
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危机爆发前宇智波止水面见三代目火影，打算在宇智波一族的集会上观察宇智波富岳的态度，如果政变无法阻止，就使用最强幻术别天神改变他的想法从而阻止叛乱。但是志村团藏并不相信他，同时也是为了夺取他的万花筒写轮眼，所以用禁术“伊邪那岐”偷袭止水。
夺取了止水的右眼，但被止水以瞬身术逃脱。团藏是因认为最强幻术别天神在自己手中会发挥更大的作用而伏击止水，并且是在依靠手下的根成员干扰止水使其分神而偷袭夺取了止水的右眼）
在失去右眼之后止水为了不让左眼再落入其手、维护宇智波之名，将左眼送给鼬，并嘱咐鼬要为了和平使用它、全力阻止宇智波政变，并且让鼬对他的事情保密，最终投南贺河自尽。
宇智波鼬亲眼目睹止水自杀，并开启万花筒写轮眼，宇智波鼬使用万花筒写轮眼阅读了神社内六道仙人留下的只有万花筒写轮眼才能阅读的文字（文字分三种能力解读：写轮眼-万花筒写轮眼-轮回眼）。
由于止水自杀且宇智波鼬并没有参加那晚的集会，宇智波族人怀疑是宇智波鼬杀死了止水，被鼬断然否定（止水本被族人要求监视不被信任的宇智波鼬）。
由于宇智波一族在与木叶的政治斗争中总受压制，一族人不甘心便在其父亲的带领下叛变木叶，鼬不得已成为双重间谍，时年13岁。之后他背负污名成为叛忍加入晓组织监视其内部动作。
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止水自杀使得宇智波族人元气大伤，士气低落，但是族人仍然决意叛变。鼬面见木叶高层汇报了这一情况，在场的高层中只有三代目火影坚持想以谈判的方式解决宇智波政变，但因为事情已经来不及改变最后只说请鼬帮他争取一点时间，事实上除了歼灭宇智波全族之外已再无其他善法。
志村团藏之后找到了宇智波鼬，以鼬的弟弟宇智波佐助的性命作为交换让宇智波鼬诛灭全族并对佐助保密，自己以叛忍的身份搜集对木叶不利的组织情报。为了保护村子防止其他国家乘虚而入，也是为了止水的意愿和弟弟的性命。鼬在痛苦与煎熬中被迫接受了灭族任务。
政变当晚宇智波鼬和宇智波带土（之前鼬找到他答应帮他向宇智波一族复仇但不许他对村子出手）一起动手诛灭了全族，宇智波鼬含泪与父母道别，他们将佐助托付给了鼬，并给弟弟设定了一个向自己复仇这一目标之后逃离木叶，临走前威胁团藏如果敢伤害佐助就将村子情报出卖敌国。逃离之后根据带土的建议加入了他的组织-晓。
三代目火影默许了这个事实并答应鼬保护他的弟弟。
由于晓组织的命令，在大蛇丸叛变“晓”之后，与干柿鬼鲛搭档两人一组四处行动。鼬与鬼鲛负责捕捉九尾的任务，两度与鸣人、卡卡西等人交手。
在大蛇丸毁灭木叶计划中三代目火影使用尸鬼封尽而牺牲，宇智波鼬和鬼鲛以刺探木叶情报为由（其实是为了警告团藏不许对宇智波佐助出手）